编写一段关于blast提取序列的Perl语言目的:根据信息,提取名称举例:.大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/22 07:05:38
编写一段关于blast提取序列的Perl语言目的:根据信息,提取名称举例:.大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提

编写一段关于blast提取序列的Perl语言目的:根据信息,提取名称举例:.大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提
编写一段关于blast提取序列的Perl语言
目的:根据信息,提取名称
举例:
.
大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提取出来,而blast结果是seqs2的不提取.

编写一段关于blast提取序列的Perl语言目的:根据信息,提取名称举例:.大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提

$  grep -n “seqs1”  |less

如果想输出到某个文件 |less 改为 >youwant.txt

编写一段关于blast提取序列的Perl语言目的:根据信息,提取名称举例:.大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提 求一段perl分割fasta中DNA序列的代码 fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释,求一段perl分割fasta中DNA序列的代码fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释,序列,注释,序列放置,分割后,在指定目 Perl代码该怎么写?有个1.txt文件内容如下:ABCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxDEFaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGHIbbbbbbbbbJKLcccccccccccccccccccc大写字母是ID名,名称不一.下面小写字母ID对应的序列,序列长度不一.如何提取ID以 编写一段关于浪费青春的短文 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?如题,在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列.……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序,不去引物的,但是现在做的内 怎么推测一段序列是否是信号肽?手头有一段植物细胞壁某个蛋白的序列,是确定没有信号肽的,也没有起始密码子和终止密码子,但是在NCBI里面blast后,全长cdna序列知道了,前面多出来那一段序列 检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问怎么设计引根据质谱检测得到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现在需要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不到同 关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC 怎么将提取的蛋白序列,用blastp搜索5个同源蛋白生物信息学的内容,老出现如下错误:Message ID#24 Error:Failed to read the Blast query:Nucleotide FASTA provided for protein sequence 基因 外显子区别 如:从一段已知序列中提取基因序列 和 提取外显子序列有什么区别吗? 用perl语言测DNA序列,全部分给你!首先先说说,DNA的碱基由ATCG四种碱基组成,假如有一段碱基序列,里面有未知的碱基,我们把未知的碱基命名为N.假如现在有一段碱基序列:ATCGNATCGNAATTCGGNTTGGANATTCGGAT 写一个随机DNA序列 100bp用的是PERL 如何用perl编写程序计算数学公式,比如计算键盘输入数字的log值 求perl的统计程序,统计病毒序列中的ATCG总数,以及各个核苷酸所占比例【病毒DNA中有四种核苷酸,即ACTG】我有从网站下载的源文件HA.fa,并且从中提取了时间和病毒序列放置到excel表格中了,时间 有没有批量处理序列的BLAST软件呢?ncbi上面没有,我这里有好多est序列. 用BLAST对比了两个蛋白序列的相似性 这张图的意思是什么.还有这个 已用本地blast找出基因序列,怎么确定它是全长的呢? ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南.